Péptido es uno de esos temas donde los detalles importan más que los titulares. Esta página reúne los antecedentes, los mecanismos y los puntos prácticos que más se consultan.
Última revisión: 2026-08-01. Cuando una afirmación depende de un estudio concreto, se describe el estudio en lugar de exagerarlo.
== Estructura == El locus Cpf1 contiene un dominio alfa/beta mixto, un RuvC-I seguido por una región helicoidal, un RuvC-II y un dominio similar a un dedo de cinc. La proteína Cpf1 tiene un dominio de endonucleasa similar a RuvC que es similar al dominio RuvC de Cas9. Además, Cpf1 no tiene un dominio de endonucleasa HNH, y el N-terminal de Cpf1 no tiene el lóbulo de reconocimiento alfa-helicoidal de Cas9. La arquitectura de dominio Cpf1 CRISPR-Cas muestra que Cpf1 es funcionalmente único, clasificándose como clase 2, tipo V CRISPR. Los loci Cpf1 codifican las proteínas Cas1, Cas2 y Cas4 más similares a los tipos I y III que a los sistemas tipo II. Las búsquedas en bases de datos sugieren la abundancia de proteínas de la familia Cpf1 en muchas especies bacterianas. Funcional Cpf1 no necesita el tracrRNA, por lo tanto, sólo CRRNA es necesario. Esto beneficia la edición del genoma porque Cpf1 no sólo es más pequeño que Cas9, sino que también tiene una molécula de sgRNA más pequeña (aproximadamente la mitad de nucleótidos que Cas9). El complejo Cpf1-crRNA escinde el ADN o ARN diana mediante la identificación de un prototipo adyacente 5'-YTN-3 ' (donde "Y" es una pirimidina y "N" es cualquier nucleobase) o 5'- TTN-3 ', en contraste con el PAM rico en G dirigido por Cas9. Después de la identificación de PAM, Cpf1 introduce una ruptura de doble hilo de ADN similar al extremo pegajoso de 4 o 5 nucleótidos sobresaliente.
Fuentes: es.wikipedia.org
== Mecanismo == El sistema CRISPR/Cpf1 consiste en una enzima Cpf1 y un ARN guía que encuentra y posiciona el complejo en el punto correcto en la doble hélice para escindir el ADN objetivo. CRISPR/Cpf1 actividad de los sistemas tiene tres etapas: Adaptación: Cas1 y Cas2 proteínas facilitar la adaptación de pequeños fragmentos de ADN en la matriz CRISPR. . Formación de crRNAs: procesamiento de pre-cr-ARNs produciendo de crRNAs maduros para guiar la proteína Cas. Interferencia: el Cpf1 está unido a un crRNA para formar un complejo binario para identificar y escindir una secuencia de ADN objetivo.
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=== Cas9 vs Cas12a (Cpf1) === Cas9 requiere dos moléculas de ARN para cortar el ADN, mientras que Cpf1 necesita uno. Las proteínas también cortan el ADN en diferentes lugares, ofreciendo a los investigadores más opciones al seleccionar un sitio de edición. Cas9 corta ambos hilos en una molécula de ADN en la misma posición, dejando atrás los extremos "romos". Cpf1 deja una hebra más larga que la otra, creando extremos "pegajosos" que son más fáciles de trabajar. Cpf1 parece ser más capaz de insertar nuevas secuencias en el sitio de corte, en comparación con Cas9. Aunque el sistema CRISPR / Cas9 puede desactivar eficazmente los genes, es difícil insertar genes o generar un clavado (knock-in). Cpf1 carece de tracrRNA, utiliza un rico en T-PAM y escinde el ADN a través de un escalonado ADN DSB. En resumen, las diferencias importantes entre Cpf1 y Cas9 sistemas son que Cpf1:
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Reconoce diferentes PAM, permitiendo nuevas posibilidades de orientación. Crea extremos pegajosos largos 4-5 nt, en vez de extremos romos producidos por Cas9, realzando la eficacia de inserciones genéticas y de especificidad durante NHEJ o HDR. Corta el ADN objetivo más lejos de PAM, más lejos del sitio de corte Cas9, permitiendo nuevas posibilidades para escindir el ADN.
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